2025年甘肃中医药大学王牌专业包括：国家级特色专业、国家级一流专业、省级一流专业。其中国家级特色专业有：针灸推拿学专业、中西医临床医学专业、中草药栽培与鉴定专业，国家级一流专业有：中药学专业、中西医临床医学专业、医学信息工程专业，省级一流专业有：中草药栽培与鉴定专业、医学检验技术专业、藏医学专业。

甘肃中医药大学国家级特色专业

国家级特色专业包含：针灸推拿学、中西医临床医学、中草药栽培与鉴定等。

甘肃中医药大学国家级一流专业

国家级一流专业包含：中药学、中西医临床医学、医学信息工程等。

甘肃中医药大学省级一流专业

省级一流专业包含：中草药栽培与鉴定、医学检验技术、藏医学等。